Obrigado a todos pela sua ajuda!
No final, a consulta abaixo me rendeu os resultados desejados - que era mostrar e classificar as postagens por um campo personalizado de "publication_date" primeiro - classificando pela data e se houvesse vários da mesma data (digamos , 4 marcado em junho de 2013), classificaria esses por título. Então, depois de percorrer todas as postagens que têm a Data de Publicação preenchida, ela repetirá as postagens restantes, alfabeticamente por título.
Isso me fornece os resultados definidos na mesma consulta e mantém minha paginação:
$term = get_queried_object();
the_post();
$wp_query = new WP_Query( array(
'post_type' => 'resource',
'tax_query' => array(
array(
'taxonomy' => 'resource_types',
'field' => 'slug',
'terms' => $term->name,
)),
'meta_query' => array(
'relation' => 'OR',
array( //check to see if date has been filled out
'key' => 'publication_date',
'compare' => '=',
'value' => date('Y-m-d')
),
array( //if no date has been added show these posts too
'key' => 'publication_date',
'value' => date('Y-m-d'),
'compare' => 'NOT EXISTS'
)
),
'meta_key' => 'publication_date',
'orderby' => 'meta_value title',
'order' => 'ASC',
'paged' => $paged,
'posts_per_page' => '10',
));