NGinx + Subdomínio Wordpress Multi com core no Subdiretório

Eu uso um servidor Nginx muito semelhante e o seguinte funciona muito bem para mim, no entanto, eu prefiro pegar uma rota diferente e dividir a configuração de blocos de servidor para "Não seguro - http" e "Seguro - https" individualmente. Além disso, de acordo com a estrutura do seu subdiretório, convém dar uma olhada neste rtcamp artigo para ajustar sua diretiva location / {} da seguinte forma:

# HTTPS Secure Server 
#
server {
    listen 443 default_server ssl;

    ssl on;
    ssl_certificate /path/to/ssl/certificate.crt;
    ssl_certificate_key /path/to/ssl/certificate.key;

    ssl_session_cache    shared:SSL:10m;
    ssl_session_timeout  10m;

   # Nginx 1.6 PCI compliance ssl directives, the first one is stronger but slower
   #It should be preferred when saving credit card and/or sensible information is needed.
   #e.g. If redirecting to payment gateways providers such as PayPal is all you need, them it can be safely disabled here.

  # ssl_ciphers  HIGH:!aNULL:!MD5;

    ssl_ciphers HIGH:!aNULL:!MD5:!kEDH;
    ssl_prefer_server_ciphers  on;

    root /srv/www/guillaumemolter/htdocs;
    index index.php;

    server_name guillaumemolter.dv *.guillaumemolter.dv;

    location / {
     try_files $uri $uri/ /wp-app/index.php?q=$uri&$args;
    }
}

    location ~ \.php$ {
            try_files      $uri = 404;
            fastcgi_pass   127.0.0.1:9000;
            fastcgi_index  index.php;
            fastcgi_param  SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;
            include        fastcgi_params;
    }

# Alternatively Pass the PHP scripts to FastCGI server listening on 127.0.0.1:9000

    #location ~ \.php$ {
            #try_files $uri =404;
            #fastcgi_split_path_info ^(.+\.php)(/.+)$;
            #fastcgi_pass unix:/var/run/php5-fpm.sock;
            #fastcgi_index index.php;
#                #include fastcgi_params;
    #}

    location ~* \.(jpg|jpeg|gif|png|bmp|ico|pdf|flv|swf|exe|html|htm|txt|css|js) {
            add_header Cache-Control public;
            add_header Cache-Control must-revalidate;
            expires 7d;
            access_log off;
    }

}

..

server {
    listen 80 default_server;
    server_name  guillaumemolter.dv *.guillaumemolter.dv 

    root   /srv/www/guillaumemolter/htdocs;
    index  index.php;

    # Simple redirect - Force non SSL site to redirect traffic to SSL
    return 301 https://guillaumemolter.dv$request_uri;
    return 301 https://guillaumemolter.dv$request_uri;


    if (!-e $request_filename) {
            rewrite /wp-admin$ $scheme://$host$uri/ permanent;         
            rewrite ^/wp-app(/[^/]+)?(/wp-.*) /wp-app$2 last;      
            rewrite ^/wp-app(/[^/]+)?(/.*\.php)$ /wp-app$2 last;
    }

    location / {
            try_files $uri $uri/ /wp-app/index.php?$args ;
    }

    location ~ \.php$ {
            try_files      $uri = 404;
            fastcgi_pass   127.0.0.1:9000;
            fastcgi_index  index.php;
            fastcgi_param  SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;
            include        fastcgi_params;
    }

# Alternatively Pass the PHP scripts to FastCGI server listening on 127.0.0.1:9000

    #location ~ \.php$ {
            #try_files $uri =404;
            #fastcgi_split_path_info ^(.+\.php)(/.+)$;
            #fastcgi_pass unix:/var/run/php5-fpm.sock;
            #fastcgi_index index.php;
#                #include fastcgi_params;
    #}

    location ~* ^.+\.(ogg|ogv|svg|svgz|eot|otf|woff|mp4|ttf|rss|atom|jpg|jpeg|gif|png|ico|zip|tgz|gz|rar|bz2|doc|xls|exe|ppt|tar|mid|midi|wav|bmp|rtf)$ {
            access_log off; log_not_found off; expires max;
    }

    location = /robots.txt { access_log off; log_not_found off; }
    location ~ /\. { deny  all; access_log off; log_not_found off; }
} 

..

E no seu arquivo index.php, altere o caminho para /wp-app/wp-blog-header.php

<?php
 /**
 * Front to the WordPress application. This file doesn't do anything, but loads
 * wp-blog-header.php which does and tells WordPress to load the theme.
 *
 * @package WordPress
 */

 /**
 * Tells WordPress to load the WordPress theme and output it.
 *
 * @var bool
 */
 define('WP_USE_THEMES', true);

 /** Loads the WordPress Environment and Template */
 require( dirname( __FILE__ ) . '/wp-app/wp-blog-header.php' );

..

Além disso, se um certificado SSl estiver configurado, verifique se o URL do site do WordPress e o URL da Página Inicial estão corretos. Ele pode ser alterado em Configurações Gerais do WordPress ou colocando-se essas duas linhas no wp-config.php, onde "example.com" é o local correto do seu site. Nota Esta não é necessariamente a melhor correção, é apenas codificar os valores no próprio site. Você não poderá mais editá-las na página Configurações gerais ao usar este método.

define('WP_HOME','https://example.com');
define('WP_SITEURL','https://example.com');